清朝初年政局動盪不安，盜賊趁亂四起，福建廣東等居民陸陸續續遷徙到台灣來，在1662年至1795年間，由施姓先祖世榜公，黃氏仕卿公等人陸續開墾，完成八堡圳、十五庄圳(現今八堡二圳)、鴻門圳等灌溉溝渠以灌溉現今社頭鄉轄域。兼之漳州南靖、漳浦、韶安、潮州、饒平等縣民大舉來台墾荒至1795年後漸成街市，遂以於嘉慶年間建成村莊，移民日增；後漢番爭地，平埔族漸形勢弱，於1823年後終徙居埔里，餘留者盡皆漢化，是時原民部落名為「大武郡社」，雖歷經西班牙、荷蘭統治，漢人仍習慣稱呼平埔族人漢居地為社，而「頭」字則因為此地為大武郡社頭目首領居住的故地，是以得名「社頭」。 而慈玄宮現址即奉觀世音菩薩指示於中華民國九十六年擇此創宮，並取慈悲為懷，玄門正統為中心命名為慈玄宮，並為社頭在地多次為鄉親服務；庇佑社頭鄉親家庭美滿事業順遂。